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2019年12月30日，全球首個 “萬種原生生物基因組計劃”（Protist 10,000 Genomes Project， 簡稱P10K）正式發(fā)布，旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜，建立一個大規(guī)模的原生生物遺傳資源數(shù)據(jù)庫。

原生生物是生物五界（植物界、真菌界、動物界、原生生物界和原核生物界）之一，主要是由單細(xì)胞真核生物組成的一大類群，包括單細(xì)胞真核藻類和原生動物等，已描述的物種數(shù)超過6萬種，未知種類難以估量。

據(jù)介紹，原生生物分布極為廣泛，只要有水的地方，就有原生生物存在。原生生物是水生態(tài)系統(tǒng)重要組分，其中的藻類貢獻(xiàn)了地球上近50%的光合行為，也是水產(chǎn)動物和人類的優(yōu)良餌料和營養(yǎng)品，另外，部分甲藻和硅藻“瘋長”會造成河流和海洋有毒藻華，帶來嚴(yán)重環(huán)境問題。

同時，很多原生生物是人、畜禽和水產(chǎn)動物的重要致病性寄生蟲，如造成人瘧疾的瘧原蟲、昏睡病的錐蟲、雞球蟲病的球蟲，造成魚白點病的小瓜蟲等。

目前，在基礎(chǔ)生物學(xué)研究方面，一些原生生物作為模式生物做出了重要貢獻(xiàn)。例如在嗜熱四膜蟲中發(fā)現(xiàn)的核酶以及端粒和端粒酶分別獲得了1989年和2009年諾貝爾獎。然而，已公開發(fā)表了基因組數(shù)據(jù)的原生生物僅400余種。

中科院水生生物研究所副所長殷站介紹，我國原生生物學(xué)研究始于上世紀(jì)20年代，中科院水生所作為我國原生生物學(xué)（原生動物學(xué)和藻類學(xué)）發(fā)源地，在王家楫院士、饒欽止先生、倪達(dá)書先生、黎尚豪院士和沈韞芬院士等一代代科學(xué)家?guī)ьI(lǐng)下，一直引領(lǐng)著我國原生生物學(xué)相關(guān)研究領(lǐng)域發(fā)展。

目前，水生所擁有一支在國內(nèi)外有重要影響的原生生物學(xué)研究團(tuán)隊，建有保藏了2500余種株真核藻類和近600種株原生動物的國家藻類和原生動物種質(zhì)庫（National Culture Collection of Algae and Protozoa），近年來，依托原生生物基因組測序和生物信息分析平臺，水生所已完成500余種原生生物的基因組測序。

“萬種原生生物基因組計劃”標(biāo)識

該計劃將依托各發(fā)起單位保藏的3000多種株真核藻類和原生動物種質(zhì)資源，通過持續(xù)的樣品采集和宏基因組數(shù)據(jù)挖掘，在未來3年（2020—2022年）完成約一萬種原生生物的基因組測序和分析，將包括原生生物全部26個門/類，覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。

開展“萬種原生生物基因組計劃”，有助于理解生物多樣性形成機(jī)制、多細(xì)胞生物/有性生殖的起源與演化等重大基礎(chǔ)生命科學(xué)問題，促進(jìn)國家科技資源共享服務(wù)平臺信息互聯(lián)互通，推動與生態(tài)環(huán)境保護(hù)、營養(yǎng)健康和疾病防治相關(guān)原生生物種質(zhì)傳資源的挖掘與應(yīng)用實踐。

值得注意的是，該計劃以開放聯(lián)盟模式運(yùn)行，國內(nèi)外有興趣的研究團(tuán)隊均可加入。

據(jù)悉，該計劃由中科院水生所聯(lián)合西藏大學(xué)、河南農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)科院蘭州獸醫(yī)研究所、中科院北京基因組研究所和華中科技大學(xué)等單位共同發(fā)起。

來源：科技日報 文中圖片由作者提供

原標(biāo)題：《我國科學(xué)家啟動“萬種原生生物基因組計劃”》

科技日報記者 劉志偉

通訊員 熊奇

媒體：科技日報 2019-12-30 16:54